MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 3384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017778	ATTTC	2	10	1341	1350	20 %	60 %	0 %	20 %	386859045
2	NC_017778	TTTTG	2	10	1370	1379	0 %	80 %	20 %	0 %	386859045
3	NC_017778	TA	4	8	1393	1400	50 %	50 %	0 %	0 %	386859045
4	NC_017778	TTG	2	6	1407	1412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859045
5	NC_017778	TC	4	8	1457	1464	0 %	50 %	0 %	50 %	386859045
6	NC_017778	CTT	2	6	1494	1499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859045
7	NC_017778	TAGCTT	2	12	1500	1511	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386859045
8	NC_017778	GTTT	2	8	1547	1554	0 %	75 %	25 %	0 %	386859045
9	NC_017778	ATA	2	6	1563	1568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859045
10	NC_017778	TA	3	6	1567	1572	50 %	50 %	0 %	0 %	386859045
11	NC_017778	TTA	2	6	1574	1579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859045
12	NC_017778	TA	3	6	1578	1583	50 %	50 %	0 %	0 %	386859045
13	NC_017778	TCT	2	6	1667	1672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859045
14	NC_017778	AAT	2	6	1676	1681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859045
15	NC_017778	TTC	2	6	1699	1704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859045
16	NC_017778	AAT	2	6	1716	1721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859045
17	NC_017778	TCT	2	6	1733	1738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859045
18	NC_017778	CTA	2	6	1743	1748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859045
19	NC_017778	ATTGC	2	10	1826	1835	20 %	40 %	20 %	20 %	386859045
20	NC_017778	CAC	2	6	1857	1862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859045
21	NC_017778	TC	3	6	1863	1868	0 %	50 %	0 %	50 %	386859045
22	NC_017778	ATG	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859045
23	NC_017778	TTTTTG	2	12	1972	1983	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386859045
24	NC_017778	TCT	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859045
25	NC_017778	TGT	2	6	2008	2013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859045
26	NC_017778	TAA	2	6	2017	2022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859045
27	NC_017778	ACA	2	6	2024	2029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386859045
28	NC_017778	AAG	2	6	2047	2052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859045
29	NC_017778	CAT	2	6	2055	2060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859045
30	NC_017778	T	7	7	2060	2066	0 %	100 %	0 %	0 %	386859045
31	NC_017778	CAT	2	6	2121	2126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859045
32	NC_017778	ATC	2	6	2146	2151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859045
33	NC_017778	ATA	2	6	2154	2159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859045
34	NC_017778	TAG	2	6	2199	2204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859045
35	NC_017778	T	7	7	2211	2217	0 %	100 %	0 %	0 %	386859045
36	NC_017778	T	6	6	2229	2234	0 %	100 %	0 %	0 %	386859045
37	NC_017778	TAG	2	6	2238	2243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859045
38	NC_017778	AC	4	8	2558	2565	50 %	0 %	0 %	50 %	386859046
39	NC_017778	CAA	2	6	2605	2610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386859046
40	NC_017778	GGA	2	6	2640	2645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386859046
41	NC_017778	AAT	2	6	2659	2664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859046
42	NC_017778	TC	3	6	2760	2765	0 %	50 %	0 %	50 %	386859046
43	NC_017778	AT	3	6	2775	2780	50 %	50 %	0 %	0 %	386859046
44	NC_017778	TTC	2	6	2840	2845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859046
45	NC_017778	A	7	7	2933	2939	100 %	0 %	0 %	0 %	386859046
46	NC_017778	TCA	2	6	2955	2960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859046
47	NC_017778	T	6	6	3006	3011	0 %	100 %	0 %	0 %	386859046
48	NC_017778	T	7	7	3560	3566	0 %	100 %	0 %	0 %	386859047
49	NC_017778	CT	3	6	3578	3583	0 %	50 %	0 %	50 %	386859047
50	NC_017778	TAA	2	6	3606	3611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859047
51	NC_017778	TTC	2	6	3613	3618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859047
52	NC_017778	TCTT	3	12	3623	3634	0 %	75 %	0 %	25 %	386859047
53	NC_017778	AGA	2	6	3655	3660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859047
54	NC_017778	ATT	2	6	3724	3729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859047
55	NC_017778	T	6	6	3761	3766	0 %	100 %	0 %	0 %	386859047
56	NC_017778	CTT	2	6	3783	3788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859047
57	NC_017778	A	7	7	3811	3817	100 %	0 %	0 %	0 %	386859047
58	NC_017778	ATATCA	2	12	3869	3880	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386859047
59	NC_017778	TTTC	2	8	3881	3888	0 %	75 %	0 %	25 %	386859047
60	NC_017778	CCT	2	6	4068	4073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386859047
61	NC_017778	AATT	2	8	4075	4082	50 %	50 %	0 %	0 %	386859047
62	NC_017778	TCA	2	6	4118	4123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859047
63	NC_017778	TCA	2	6	4148	4153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859047
64	NC_017778	TCT	2	6	4169	4174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859047
65	NC_017778	TTG	2	6	4285	4290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859047
66	NC_017778	CCCT	2	8	4306	4313	0 %	25 %	0 %	75 %	386859047
67	NC_017778	TCT	2	6	4331	4336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859047
68	NC_017778	TAT	2	6	4374	4379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859047
69	NC_017778	ATA	2	6	4482	4487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859047
70	NC_017778	TTC	2	6	4496	4501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859047
71	NC_017778	TTAA	2	8	4799	4806	50 %	50 %	0 %	0 %	386859048
72	NC_017778	AT	3	6	4815	4820	50 %	50 %	0 %	0 %	386859048
73	NC_017778	GAA	2	6	4873	4878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859048
74	NC_017778	ATCA	2	8	4915	4922	50 %	25 %	0 %	25 %	386859048
75	NC_017778	CAA	2	6	4942	4947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386859048
76	NC_017778	AGA	2	6	4952	4957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859048
77	NC_017778	AAT	2	6	5136	5141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859048
78	NC_017778	ATA	3	9	5275	5283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859048
79	NC_017778	ATA	2	6	5394	5399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859048
80	NC_017778	A	8	8	5438	5445	100 %	0 %	0 %	0 %	386859048
81	NC_017778	TAA	2	6	5492	5497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859048
82	NC_017778	TAA	2	6	5540	5545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859048
83	NC_017778	TAA	2	6	5561	5566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859048
84	NC_017778	GCA	2	6	5573	5578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859048
85	NC_017778	TAAA	2	8	5880	5887	75 %	25 %	0 %	0 %	386859049
86	NC_017778	TGA	2	6	5920	5925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859049
87	NC_017778	GA	3	6	5924	5929	50 %	0 %	50 %	0 %	386859049
88	NC_017778	GA	3	6	5961	5966	50 %	0 %	50 %	0 %	386859049
89	NC_017778	AG	3	6	5973	5978	50 %	0 %	50 %	0 %	386859049
90	NC_017778	ATT	2	6	5997	6002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859049
91	NC_017778	AGT	2	6	6037	6042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859049
92	NC_017778	TTG	2	6	6072	6077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859049
93	NC_017778	AGA	2	6	6145	6150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859049
94	NC_017778	AGA	2	6	6166	6171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859049
95	NC_017778	ATA	2	6	6207	6212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859049
96	NC_017778	A	7	7	6212	6218	100 %	0 %	0 %	0 %	386859049
97	NC_017778	AG	3	6	6233	6238	50 %	0 %	50 %	0 %	386859049
98	NC_017778	AAT	2	6	6248	6253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859049
99	NC_017778	TCT	2	6	6272	6277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859049
100	NC_017778	ATA	2	6	6306	6311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859049
101	NC_017778	TA	3	6	6351	6356	50 %	50 %	0 %	0 %	386859049
102	NC_017778	AAT	2	6	6383	6388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859049
103	NC_017778	AAG	2	6	6432	6437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859049
104	NC_017778	A	6	6	6498	6503	100 %	0 %	0 %	0 %	386859049
105	NC_017778	AAAG	2	8	6954	6961	75 %	0 %	25 %	0 %	386859050
106	NC_017778	AGA	2	6	7034	7039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859050
107	NC_017778	ACAA	2	8	7055	7062	75 %	0 %	0 %	25 %	386859050
108	NC_017778	TAT	2	6	7086	7091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859050
109	NC_017778	GTTT	2	8	7129	7136	0 %	75 %	25 %	0 %	386859050
110	NC_017778	AAT	2	6	7232	7237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859050
111	NC_017778	TTA	2	6	7269	7274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859050
112	NC_017778	CTG	2	6	7279	7284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859050
113	NC_017778	ATA	2	6	7344	7349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859050
114	NC_017778	GAT	2	6	7455	7460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859050
115	NC_017778	TAA	2	6	7516	7521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859050
116	NC_017778	AGA	2	6	7535	7540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859050
117	NC_017778	A	7	7	7548	7554	100 %	0 %	0 %	0 %	386859050
118	NC_017778	TA	3	6	7564	7569	50 %	50 %	0 %	0 %	386859050
119	NC_017778	ACA	2	6	7603	7608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386859050
120	NC_017778	TAA	2	6	7652	7657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859050
121	NC_017778	TAAT	2	8	7697	7704	50 %	50 %	0 %	0 %	386859050
122	NC_017778	AT	3	6	8918	8923	50 %	50 %	0 %	0 %	386859051
123	NC_017778	GA	3	6	8924	8929	50 %	0 %	50 %	0 %	386859051
124	NC_017778	ATTTA	2	10	8936	8945	40 %	60 %	0 %	0 %	386859051
125	NC_017778	TTTG	2	8	8948	8955	0 %	75 %	25 %	0 %	386859051
126	NC_017778	TAT	2	6	8957	8962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859051
127	NC_017778	A	7	7	9009	9015	100 %	0 %	0 %	0 %	386859051
128	NC_017778	TCA	2	6	9024	9029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859051
129	NC_017778	A	8	8	9029	9036	100 %	0 %	0 %	0 %	386859051
130	NC_017778	A	6	6	9050	9055	100 %	0 %	0 %	0 %	386859051
131	NC_017778	TAA	2	6	9058	9063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859051
132	NC_017778	C	6	6	9065	9070	0 %	0 %	0 %	100 %	386859051
133	NC_017778	ACC	2	6	9077	9082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859051
134	NC_017778	TAA	2	6	9154	9159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859051
135	NC_017778	C	6	6	9161	9166	0 %	0 %	0 %	100 %	386859051
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137	NC_017778	TAA	2	6	9323	9328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859051
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